В начале 2000 г. московские атеисты, связанные с сайтом "Научный атеизм" и атеистическое крыло Российского Гуманистического Общества образовали инициативную группу по созданию Российского Движения Атеистов. В качестве одной из базовых структур будущего Движения было основано Атеистическое Общество Москвы (АТОМ). Основной уставной задачей общества является "правозащитная, просветительская общественная деятельность в целях отстаивания взглядов, чести и достоинcтва неверующих граждан".

Однако некоторые московские чиновники, например, замначальника ГУ минюста по Москве господин Жбанков, до сих пор чинят препятствия в регистрации этой общественной организации.

Несмотря на это, АТОМ осуществляет активную деятельность и проводит дискуссии с оппонентами, в том числе на страницах независимой прессы, которая заметила наше общество. Заметили его и наши противники - в ряде черносотенных клерикальных изданий прошла информация о деятельности "одиозного атеистического общества". Это хорошая новость - раз нас опасаются такие силы, значит мы делаем что-то полезное.